המטה למאבק בגזענות הוקם בשנת 2003 ביוזמתו של מרכז מוסאוא לזכויות האזרחים הערבים בישראל, וכיום חברים בו יותר מארבעים קבוצות וארגונים ללא כוונות רווח שמייצגים מגוון של קהילות וקבוצות. מטרתו העיקרית של המטה להילחם בגזענות ובאפליה מוסדית וכן בגזענות בין אנשים. המטה פועל בזירה האזרחית באמצעות קמפיינים, הקמת פורומים מקומיים ואזוריים למאבק בגזענות וקידום שותפות באמצעות אירועי תרבות. עוד פועל המטה כדי לקדם מפגשים של נציגים מהקהילות במטרה להגביר את הסולידריות בין הקבוצות – הן הקבוצות קורבנות הגזענות והן הקבוצות האחרות – ומפעיל תכניות חינוך בארגונים ובמוסדות רבים.

פעילות החינוך של המטה מתבטאת בעבודה עם משרד החינוך ועם ועדת החינוך של הכנסת במטרה לקדם תכניות חינוך לזכויות אדם ולשותפות וכן תכניות נגד גזענות. בשנים האחרונות המטה גם מקיים פעילות חינוכית רחבה בנושאים אלה עם מוסדות חינוך ברחבי הארץ ועם קהילות וארגונים מקומיים. בכלל פעילויות החינוך של המטה: כנסים וימי עיון למורים ולמחנכים; הרצאות לפני תלמידי מכינות; פסטיבלים והרצאות נגד גזענות בבתי ספר תיכון; והרצאות וסדנאות לתלמידי בתי ספר יסודיים. את הפעילות החינוכית של המטה מייחד האופן שהיא משקפת את מגוון הקבוצות והקהילות בישראל.